Tijela Udruge su: Skupština, Upravni odbor, Predsjednik, Nadzorni odbor
Skupština je najviše tijelo Udruge, a čine ju svi redovni članovi Udruge. Skupštini predsjedava Predsjednik Udruge.
Upravni odbor izvršno je tijelo Udruge i upravlja radom Udruge između dvije sjednice Skupštine. Upravni odbor čine Predsjednik Udruge, dva potpredsjednika i 3 člana koje bira Skupština na vrijeme od četiri godine.
Predsjednik Udruge predstavlja i zastupa udrugu.
Predjednik Udruge osigurava pravilan i zakonit rad Udruge. Za svoj rad Predsjednik Udruge odgovara Skupštini Udruge. Predsjednik Udruge ujedno je i predsjednik Skupštine i predsjednik Upravnog odbora. Predsjednik Udruge zastupa Udrugu, sklapa ugovore i poduzima druge pravne radnje u ime i za račun Udruge, a Udruga ima dva potpredsjednika.
Nadzorni odbor nadzire zakonitost djelovanja i pravilnost poslovanja Udruge.
Tajnika imenuje Upravni odbor Udruge na razdoblje od četiri godine.
Bitno je istaknuti da Udruga ima i radna tijela, koja obogaćuju rad udruge.
Posebno se ističe angažman mladih u okviru djelovanja unutar odbora: Youth Atlantic Treaty Association Croatia – Mladi Atlantskog vijeća Hrvatske.
Postoji također i Odbor za suradnju s regionalnim i međunarodnim organizacijama te posebice euroatlantskim integracijama (ističe se suradnja s: NATO, EU, UN); Odbor za suradnju s institucijama u RH, te Odbor za aktiviranje udruge u projektnim djelatnostima.